Genetic variability of different Ajloun (Jordanian) almond landraces (Prunus amygdalus L.) revealed

Details: Category: Plant Production; Published: Wednesday, 24 February 2016 02:00; Written by Rasha Talal Amarin; Hits: 3865

Genetic diversity of different Ajloun (Jordanian) almond (Prunus amygdalus L.)

landraces revealed by morphological traits and RAPD markers
Rasha Talal Amarin
Mu'tah University, 2012

Six almond landraces were collected from Ajloun district (Jordan) collected to estimate the level of diversity among these landraces. The local names of these landraces are Hagari, Oga, Mukhmaly, Hami Hallo, Fark and Abu Dabos. The morphological characterization of leaves, nuts, kernel and tree habit as well as RAPD markers were used to estimate the genetic variability among studied almond landraces. The relationships among six Jordanian almond landraces were investigated using multivarient analyses including principle component analysis (PCA) and dendograms based on genetic distances. PCA showed that the first five components explained all morphological variation among existed among landraces. Kernel and nut traits were predominant in the first three components contributed most of the total variation existed among landraces. Euclidean distance was used to construct clusters from morphological data which allocated individuals into two main groups with a distance ranged from 5.5 to 10.14. Hajari, Hami Hallo and Mukmaly with small fruit sizes composed one main cluster, while the other three landraces (Oga, Fark and Abu Dabos) with large fruit size constructed the other main cluster. Out of 62 pre-screened RAPD primers, 12 with reproducible bands and maximum polymorphism were selected for diversity analysis. Seventy one bands were scored with 28 of them were polymorphic. Average value of polymorphism per primer ranged from 20% to 74.2%. Nei's genetic distance coefficient ranged from 0.5 to 0.85 with an average of 0.70. Molecular analysis revealed inconsistent separation among landraces compare with that based on morphological traits. Although landraces found during our screening in Ajloun area are limited in number, but considerable variation was observed both at morphological and DNA levels indicating that the Jordanian almond landraces are rich and valuable genetic material for almond improvement.

التباين الوراثي في سلالات اللوز البلدي من عجلون (الاردن) باستخدام الصفات الشكلية و البصمة الوراثية ((RAPD
رشــــا طــــلال عــمــاريـــن
جــامـعـة مـؤتــة , 2012

تم دراسة التبلين الوراثي لستة سلالات لوز بلدية جمعت من منطقة عجلون هي: مخملي, عوجا, حجري, حامي حاله, فرك, أبو دبوس. أستخدمت الصفات الشكلية للاوراق و البندقة و البذرة و طبيعة نمو الأشجار و كما استحدمت البصمة الوراثية ((RAPD لتقييم التباين الوراثي لسلالات اللوز الستة. اظهرت نتائج التحليل العاملي ان اول خمسه مكونات فسرت كل التنوع الشكلي الموجود في السلالات المدروسه, و كانت الصفات المرتبطه بالبندقة و البذرة هي السائدة في المكونات الثلاث الاولى. وضعت المسافة الاقليدية السلالات في مجموعتين رئيسيتين هما الحجري و حامي حاله و المخملي في مجموعة و التي تميزت باحجام ثمار صغيرة بينما جمعت الاصناف الثلاث الاخرى عوجا و فرك و ابو دبوس المتميزة باحجام ثمار كبيرة في مجموعة رئيسية أخرى. كانت المسافة الوراثية بناءا على المسافة الاقليدية واسعة تراوحت ما بين 5.5 الى 10.14 . تم تجريب 62 بادئ من بادئات ال RAPD, و اظهرت الدراسة أن 12 بادئ اعطت اختلافات كبيرة حيث تم اختيارها لدراسة التنوع بين السلالات. كان عدد المؤشرات التي اعطت اختلافات 28 و تراوحت الاختلافات للمؤشرات ما بين 20- 74.2%. تراوحت المسافة الوراثية المحسوبة على اساس Nie من 0.5-0.85% و معدل 0.70. كانت المسافات المحسوبة على اساس المؤشرات الجزيئية غير متوافقة مع المسافات الوراثية للصفات الشكلية. بالرغم من ان اعداد السلالات الموجودة في منطقة عجلون محدودة من حيث العدد الا ان الاصناف اظهرت تباين كبير في الصفات الشكلية و الحامض الرايبوزي منقوص الاوكسجين. اظهرت نتائج الدراسة ان سلالات اللوز الاردني غنية بالجينات اللازمة لتحسين اللوز.